MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia conorii str. Malish 7

Total Repeats: 25774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003103	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891924
2	NC_003103	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891924
3	NC_003103	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891924
4	NC_003103	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	15891924
5	NC_003103	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891924
6	NC_003103	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891924
7	NC_003103	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891924
8	NC_003103	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891924
9	NC_003103	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891924
10	NC_003103	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891924
11	NC_003103	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	15891924
12	NC_003103	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	15891924
13	NC_003103	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891924
14	NC_003103	ATA	2	6	1153	1158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891925
15	NC_003103	AAAGTA	2	12	1186	1197	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15891925
16	NC_003103	TGA	2	6	1212	1217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891925
17	NC_003103	GTA	2	6	1250	1255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891925
18	NC_003103	CAA	2	6	1312	1317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891925
19	NC_003103	A	7	7	1316	1322	100 %	0 %	0 %	0 %	15891925
20	NC_003103	TAA	2	6	1341	1346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891925
21	NC_003103	TCT	2	6	1461	1466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891926
22	NC_003103	A	6	6	1469	1474	100 %	0 %	0 %	0 %	15891926
23	NC_003103	TC	3	6	1479	1484	0 %	50 %	0 %	50 %	15891926
24	NC_003103	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	15891926
25	NC_003103	AT	3	6	1604	1609	50 %	50 %	0 %	0 %	15891926
26	NC_003103	TA	3	6	1722	1727	50 %	50 %	0 %	0 %	15891926
27	NC_003103	ATA	3	9	1725	1733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891926
28	NC_003103	A	7	7	1751	1757	100 %	0 %	0 %	0 %	15891926
29	NC_003103	GTA	2	6	1791	1796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891926
30	NC_003103	TGA	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891926
31	NC_003103	GAA	2	6	1948	1953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891926
32	NC_003103	AAT	2	6	1978	1983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891926
33	NC_003103	AAG	2	6	1995	2000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891926
34	NC_003103	TTA	2	6	2033	2038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891926
35	NC_003103	CAA	3	9	2096	2104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891926
36	NC_003103	T	8	8	2128	2135	0 %	100 %	0 %	0 %	15891927
37	NC_003103	A	6	6	2138	2143	100 %	0 %	0 %	0 %	15891927
38	NC_003103	T	6	6	2203	2208	0 %	100 %	0 %	0 %	15891927
39	NC_003103	T	6	6	2263	2268	0 %	100 %	0 %	0 %	15891927
40	NC_003103	T	6	6	2272	2277	0 %	100 %	0 %	0 %	15891927
41	NC_003103	GA	3	6	2290	2295	50 %	0 %	50 %	0 %	15891927
42	NC_003103	CGG	2	6	2317	2322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891927
43	NC_003103	AGC	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891927
44	NC_003103	ATA	2	6	2393	2398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891927
45	NC_003103	A	7	7	2398	2404	100 %	0 %	0 %	0 %	15891927
46	NC_003103	T	7	7	2422	2428	0 %	100 %	0 %	0 %	15891927
47	NC_003103	TA	3	6	2454	2459	50 %	50 %	0 %	0 %	15891927
48	NC_003103	TTTTA	2	10	2494	2503	20 %	80 %	0 %	0 %	15891927
49	NC_003103	ATA	2	6	2531	2536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891927
50	NC_003103	TAA	2	6	2562	2567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891927
51	NC_003103	TTAT	2	8	2655	2662	25 %	75 %	0 %	0 %	15891927
52	NC_003103	AT	3	6	2714	2719	50 %	50 %	0 %	0 %	15891927
53	NC_003103	ATG	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891927
54	NC_003103	TAT	2	6	2812	2817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891927
55	NC_003103	TTA	2	6	2826	2831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891927
56	NC_003103	ATTTA	2	10	2847	2856	40 %	60 %	0 %	0 %	15891927
57	NC_003103	TTAT	2	8	2877	2884	25 %	75 %	0 %	0 %	15891927
58	NC_003103	A	6	6	2941	2946	100 %	0 %	0 %	0 %	15891928
59	NC_003103	CTC	2	6	3023	3028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891928
60	NC_003103	TC	3	6	3027	3032	0 %	50 %	0 %	50 %	15891928
61	NC_003103	ATT	2	6	3034	3039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
62	NC_003103	ATT	2	6	3047	3052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
63	NC_003103	T	6	6	3090	3095	0 %	100 %	0 %	0 %	15891928
64	NC_003103	ATT	2	6	3160	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
65	NC_003103	A	7	7	3204	3210	100 %	0 %	0 %	0 %	15891928
66	NC_003103	A	6	6	3221	3226	100 %	0 %	0 %	0 %	15891928
67	NC_003103	AACT	2	8	3260	3267	50 %	25 %	0 %	25 %	15891928
68	NC_003103	CAAA	2	8	3306	3313	75 %	0 %	0 %	25 %	15891928
69	NC_003103	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
70	NC_003103	AGA	2	6	3348	3353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
71	NC_003103	AGC	2	6	3363	3368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891928
72	NC_003103	TGC	2	6	3375	3380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891928
73	NC_003103	TG	3	6	3395	3400	0 %	50 %	50 %	0 %	15891928
74	NC_003103	A	6	6	3476	3481	100 %	0 %	0 %	0 %	15891928
75	NC_003103	A	7	7	3494	3500	100 %	0 %	0 %	0 %	15891928
76	NC_003103	GA	3	6	3502	3507	50 %	0 %	50 %	0 %	15891928
77	NC_003103	T	6	6	3531	3536	0 %	100 %	0 %	0 %	15891928
78	NC_003103	ATT	2	6	3566	3571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
79	NC_003103	TATT	2	8	3573	3580	25 %	75 %	0 %	0 %	15891928
80	NC_003103	GAG	2	6	3643	3648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15891928
81	NC_003103	TCGC	2	8	3703	3710	0 %	25 %	25 %	50 %	15891928
82	NC_003103	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	15891928
83	NC_003103	TAT	2	6	3804	3809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
84	NC_003103	GCA	2	6	3832	3837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891928
85	NC_003103	AGA	2	6	3930	3935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
86	NC_003103	AT	3	6	3964	3969	50 %	50 %	0 %	0 %	15891928
87	NC_003103	CTA	2	6	4025	4030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891928
88	NC_003103	TAT	2	6	4081	4086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
89	NC_003103	TTA	2	6	4087	4092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
90	NC_003103	GGTCA	2	10	4094	4103	20 %	20 %	40 %	20 %	15891928
91	NC_003103	TGT	2	6	4107	4112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891928
92	NC_003103	AT	3	6	4274	4279	50 %	50 %	0 %	0 %	15891928
93	NC_003103	AG	3	6	4293	4298	50 %	0 %	50 %	0 %	15891928
94	NC_003103	ATA	2	6	4301	4306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
95	NC_003103	TA	3	6	4381	4386	50 %	50 %	0 %	0 %	15891928
96	NC_003103	GGC	2	6	4552	4557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891928
97	NC_003103	GCA	2	6	4576	4581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891928
98	NC_003103	A	6	6	4603	4608	100 %	0 %	0 %	0 %	15891928
99	NC_003103	TA	3	6	4633	4638	50 %	50 %	0 %	0 %	15891928
100	NC_003103	GGA	2	6	4653	4658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15891928
101	NC_003103	GAA	2	6	4675	4680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
102	NC_003103	AAG	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
103	NC_003103	AAT	2	6	4717	4722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
104	NC_003103	GAA	2	6	4723	4728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
105	NC_003103	TAA	2	6	4743	4748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
106	NC_003103	CTA	2	6	4767	4772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891928
107	NC_003103	TA	3	6	4799	4804	50 %	50 %	0 %	0 %	15891928
108	NC_003103	GAG	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15891928
109	NC_003103	AT	3	6	4825	4830	50 %	50 %	0 %	0 %	15891928
110	NC_003103	CGT	2	6	4933	4938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891928
111	NC_003103	TG	3	6	4956	4961	0 %	50 %	50 %	0 %	15891928
112	NC_003103	CAAAAC	2	12	5028	5039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891928
113	NC_003103	TCAAT	2	10	5073	5082	40 %	40 %	0 %	20 %	15891928
114	NC_003103	GTAGT	2	10	5129	5138	20 %	40 %	40 %	0 %	15891928
115	NC_003103	AAG	2	6	5159	5164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
116	NC_003103	ACG	2	6	5168	5173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891928
117	NC_003103	ATA	2	6	5195	5200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
118	NC_003103	ATT	2	6	5246	5251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
119	NC_003103	TAA	2	6	5268	5273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
120	NC_003103	AATA	2	8	5274	5281	75 %	25 %	0 %	0 %	15891928
121	NC_003103	GAT	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891928
122	NC_003103	ATTC	2	8	5311	5318	25 %	50 %	0 %	25 %	15891928
123	NC_003103	TGC	2	6	5325	5330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891928
124	NC_003103	T	6	6	5353	5358	0 %	100 %	0 %	0 %	15891928
125	NC_003103	ATT	2	6	5369	5374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
126	NC_003103	TGC	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891928
127	NC_003103	TTAA	2	8	5443	5450	50 %	50 %	0 %	0 %	15891928
128	NC_003103	CTA	2	6	5477	5482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891928
129	NC_003103	AGT	2	6	5514	5519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891928
130	NC_003103	CGC	2	6	5540	5545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891928
131	NC_003103	A	7	7	5563	5569	100 %	0 %	0 %	0 %	15891928
132	NC_003103	TTA	2	6	5605	5610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
133	NC_003103	ATA	2	6	5627	5632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
134	NC_003103	TAA	2	6	5696	5701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
135	NC_003103	ATA	2	6	5719	5724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
136	NC_003103	GAA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
137	NC_003103	A	6	6	5742	5747	100 %	0 %	0 %	0 %	15891928
138	NC_003103	ATA	2	6	5773	5778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
139	NC_003103	ATG	2	6	5806	5811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891928
140	NC_003103	AT	3	6	5859	5864	50 %	50 %	0 %	0 %	15891928
141	NC_003103	CAAAAT	2	12	5881	5892	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15891928
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271	NC_003103	AT	3	6	12834	12839	50 %	50 %	0 %	0 %	15891937
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273	NC_003103	TA	3	6	12862	12867	50 %	50 %	0 %	0 %	15891937
274	NC_003103	A	7	7	12896	12902	100 %	0 %	0 %	0 %	15891937
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279	NC_003103	GTA	2	6	13066	13071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891937
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287	NC_003103	T	6	6	13637	13642	0 %	100 %	0 %	0 %	15891938
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299	NC_003103	ATA	2	6	13956	13961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891938
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401	NC_003103	ATTTAG	2	12	19513	19524	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15891942
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403	NC_003103	AAC	2	6	19552	19557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891942
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405	NC_003103	AAT	2	6	19641	19646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
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